El campo de la microbiología puede ser dividido en varias subdisciplinas:
Fisiología microbiana:
estudio a nivel bioquímico del funcionamiento de las células microbianas. Incluye el estudio del crecimiento, el metabolismo y la estructura microbianas Incluye el estudio del crecimiento, el metabolismo y las estructuras microbianas. Este ccomplejo estructural y funcional altamente organizado, auto-delimitado por unabarrera de permeabilidad (membrana citoplásmica), que intercambia materia y energía con el medio (metabolismo), en forma estrictamente controlada (regulación). A nivel celular, y dicho en otros términos,esta función regula y controla nuestro nivel de energía y delimita los alcances físicos del ser humano.
Genética microbianahay que tener en cuenta que una de las características de ésta es el hecho de que los microorganismos se pueden estudiar de un modo fácil y rápido, esto es debido a que su distribución es generalmente muy amplia, su tamaño es microscópico, su ciclo vital es relativamente corto y muy simple en comparación con el de organismos más desarrollados y tienden tanto a vivir formando colonias como a generar una abundante descendencia. En lo que respecta a la genética, hay que destacar que un ciclo de vida simple asociado a una gran descendencia favorece el análisis génico del ADN de estos organismos, o lo que es lo mismo, gracias a esto podemos llevar a cabo un estudio detallado sobre mutaciones, expresión génica, variabilidad genotípica y fenotípica...
Los microorganismos comprenden formas de vida procariotas (bacterias principalmente), formas eucariotas (como algas, hongos y protozoos) y hasta otro tipo de organismos, los virus. En común todos estos microorganismos tienen en común las características detalladas en el párrafo anterior, pero además cada una de ella presenta ciertas características únicas.
Microbiología clínica:
Es una rama de la biología sistemática y de la ecología que trata de los microbios en cuanto son capaces de producir enfermedades en el hombre. Los virus son agentes infecciosos de estructura subcelular que por su tamaño microscópico se agrupan con losmicroorganismos, aun cuando actualmente hay grandes discusiones acerca de su cualidad de seres vivos.
Microbiología médica
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Microbiología Médica estudia la diversidad de microorganismos patógenos (bacterias, virus, hongos y parásitos) que son capaces de producir en el hombre enfermedad. Recomendada para estudiantes de salud, especialmente para microbiólogos.}
Microbiología veterinaria:
El estudio de la Microbiología veterinaria permite conocer de las bacterias y microbios que afectan directamente a los animales y los que afectan al hombre por el contacto directo con los animales.
La microbiología ambiental
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